Την εορτή της Γεννήσεως του αξιότιμου και ένδοξου Προφήτη, Προδρόμου και Βαπτιστή του Κυρίου Ιωάννη, ο Ηγούμενος Γαβριήλ (Baglay), ηγούμενος της Μονής Nilo-Stolobenskaya, γιόρτασε τη Θεία Λειτουργία στην εκκλησία των Θεοφανείων του μοναστηριού. Υπηρετήθηκε από τους αδελφούς σε ιερές εντολές.
Μετά τη λειτουργία, πραγματοποιήθηκε πομπή στην ερειπωμένη εκκλησία αφιερωμένη στον Βαπτιστή Ιωάννη.

***
Στη Δυτική υπερυψωμένη ακτή του νησιού Stolobny υπήρχε μια πέτρινη διώροφη τετράγωνη πεντάτρουλη εκκλησία στο όνομα του Αγίου Προφήτη Ιωάννη του Βαπτιστή και Βαπτιστή, χτισμένη το 1777-1781 με την ευλογία του Αρχιεπισκόπου Πλάτων του Τβερ, εξαρτώμενου από τον γαιοκτήμονα Ιβάν Σεργκέιεβιτς Τσελίστσεφ και αφιερώθηκε το 1781 στις 27 Δεκεμβρίου από τον Αρχιμανδρίτη Ιωάννη του μοναστηριού.
Η εκκλησία βρισκόταν στο σημείο όπου βρισκόταν το σπήλαιο του Αγίου Νείλου, το οποίο είχε σκάψει τις πρώτες ημέρες μετά την άφιξή του στο νησί για καταφύγιο για τον πρώτο χειμώνα, και όπου το 1766 ο Επίσκοπος Γαβριήλ του Τβερ είχε την ευλογία να χτίσει ένα πέτρινο παρεκκλήσι. 
Στον κάτω όροφο αυτής της εκκλησίας υπήρχε ένας ναός στο όνομα της μεσολάβησης της Υπεραγίας Θεοτόκου, που χτίστηκε και αφιερώθηκε το 1798. Στη βορειοδυτική γωνία αυτού του κατώτερου ναού, στον τόπο όπου βρισκόταν το προαναφερθέν σπήλαιο του Αγίου Νείλου, έμεινε μια εσοχή που αντιπροσωπεύει το ίδιο το σπήλαιο. Ο χώρος του σπηλαίου, που ήταν προηγουμένως γνωστός με θρύλο, ανακαλύφθηκε το 1777, ενώ σκάβονταν τάφροι για την ίδρυση αυτού του ναού. 

Το σπήλαιο του Αγίου ήταν ένα ιδιαίτερα σεβαστό μέρος μεταξύ των προσκυνητών. Σε αυτή την εσοχή εγκαταστάθηκε η πρώτη γλυπτική εικόνα του Αγίου Νείλου "στην τέλεια εικόνα και ηλικία του". και πολλοί, στρέφοντας στον Άγιο, έλαβαν βοήθεια και θεραπεία μέσω αυτού. Ο πρύτανης αυτού του ναού, Ι.Σ. Τσελίστσεφ, θάφτηκε επίσης κάτω από αυτήν την εκκλησία, ο οποίος δεν έζησε πολύ πριν από την αφιέρωση του ναού που έχτισε. Το αδελφικό νεκροταφείο του μοναστηριού βρισκόταν σε αυτή την εκκλησία.
Υπό τη σοβιετική κυριαρχία, ο ναός ισοπεδώθηκε. Ήδη σήμερα, με τις προσπάθειες εθελοντών από το Ορθόδοξο κίνημα νεολαίας, τα ερείπια του ναού και του ιδρύματος έχουν ανασκαφεί και καθαριστεί.