Преподобний Арсеній народився в Москві в другій половині XV століття в боярському роду Сахарусових. З юності прагнучи присвятити себе Богу, він залишив мирське життя і прийняв чернечий постриг в Троїцькій обителі, заснованої преподобним Сергієм Радонезьким.
Молодий чернець старанно виконував послуху, охоче трудився за інших, поєднуючи пост і молитву з читанням і переписуванням духовних книг. У 1506 році він переписав Євангеліє, залишивши на ньому смиренний напис: «писав Євангеліє Многогрішний чернець Арсеньішко Сахарусов».
У 1525 році братія одноголосно обрала Арсенія ігуменом. Прийнявши настоятельство з послуху, він зберіг колишню строгість життя: носив старий одяг, дбав про братії і трудився більше інших. Навіть великий князь Василь Іоаннович, який відвідував монастир, дивувався бідності його облачення. Однак шана і численні турботи обтяжували подвижника, який бажав відокремленої молитви.
В кінці 1520-х років преподобний таємно покинув обитель і відправився в вологодські ліси. Після довгих мандрів він оселився в Комельському лісі, біля злиття річок Лежи і Кохтиша. Тут Святий побудував невелику келію і віддався праці і молитві. Але місцеві жителі, які побоювалися появи монастиря і втрати земель, стали гнобити відлюдника. Після вбивства жив з ним старця Арсеній пішов у Шилегонский ліс.
Поступово і нове місце його подвигів стало відомо людям. До преподобного приходили за духовною порадою, а деякі залишалися поруч, бажаючи чернечого життя під його керівництвом. Так виникла нова пустель. Арсеній приймав приходили з батьківською любов'ю і вчив їх любити Бога і ближніх. У 1538 році, під час руйнівного набігу, в лісах біля обителі знайшли притулок навколишні жителі. За свідченням житія, молитвами святого вони залишилися неушкоджені.
Пізніше преподобний повернувся в Комельський ліс разом з учнем Герасимом. Отримавши княжу грамоту, що захищала обитель від утисків, ченці почали розчищати землю і влаштовувати монастирське господарство. У 1541 році тут освятили храм на честь положення ризи Пресвятої Богородиці у Влахерні. Так виникла Комельська Ризоположенська обитель.
Святий наставляв братію і мирян, відвідував навколишні селища, проповідував Слово Боже, закликав до чесності, молитви і дотримання християнських заповідей. Його житіє зберегло розповіді про прозорливість подвижника і чудесної допомоги по його молитвам.
Передчуваючи кончину, преподобний призначив наступником Герасима і заповідав братії любити один одного і зберігати монастирський Статут. Причастившись Святих Христових Таїн, він мирно помер 24 серпня 1550 року. Його поховали біля вівтаря монастирського храму. Незабаром біля гробниці святого стали відбуватися зцілення. Пам'ять преподобного Арсенія збереглася як приклад смирення, молитовного подвигу і діяльної любові до ближніх.